Die Wassertemperatur in Kroatien ist interessant für Studienzwecke und wird bereits seit über 30 Jahren systematisch erfasst und überwacht. Die Adria ist ein warmes Meer. Im Sommer liegt die Wassertemperatur an der Oberfläche des offenen Meeres in Kroatien zwischen 23 und 25 Grad Celsius, während die tiefsten Gewässer Temperaturen von 11 bis 13 Grad Celsius aufweisen. Die Wassertemperatur in Kroatien sinkt generell von der Oberfläche zum Boden hin ab. Entlang der Küste sind die Temperaturen etwas höher, insbesondere in flachen und geschlossenen Buchten. In der warmen Jahreszeit, vor allem im Sommer, gibt es in einer Tiefe von 10 bis 30 Metern von der Oberfläche einen Temperaturanstieg, der in mehreren Metern Tiefe am schnellsten abnimmt. In einer Tiefe von 70 Metern beträgt die Wassertemperatur in Kroatien 18 bis 19 Grad Celsius. Im Herbst beginnt sich das Meer in Kroatien an der Oberfläche abzukühlen. Im Winter variiert die Wassertemperatur in Kroatien an der Oberfläche zwischen 14 und 16 Grad Celsius, wobei das Minimum bei etwa 12 bis 10 Grad Celsius liegt. Im Winter ist die südliche Adria wärmer als die nördliche, und der Temperaturunterschied zwischen der nördlichen und südlichen Adria beträgt 8 bis 10 Grad Celsius. Flache Gewässer der nördlichen Adria, Häfen, Buchten und Flussmündungen kühlen im Winter auf 4 bis 6 Grad Celsius ab. Es gibt kein Meereis in der Adria.
Im Frühling beginnt das Meer sich zu erwärmen und erreicht bald eine für das Baden geeignete Temperatur von 18 bis 22 Grad Celsius. Im Sommer erwärmt sich das Meer in Kroatien am stärksten. Die Höchsttemperaturen treten im Juli auf und dauern bis Mitte September an, sie liegen zwischen 23 und 26 Grad Celsius. Im Sommer ist das Meer kühler als die Luft und verhindert eine signifikante Erwärmung, während es im Winter wärmer als die Luft ist und diese erwärmt. Auf diese Weise wirkt das Meer in Kroatien als Regulator der Lufttemperatur und mildert die Höchsttemperaturen im Sommer und die Tiefsttemperaturen im Winter ab. Die Küstenregion, insbesondere entlang der Gebirgsmassive, ist reich an unterseeischen Süßwasserquellen – den sogenannten „Vruljas“. Bekannte Vruljas gibt es entlang der Küste im Velebit-Kanal, Brač-Kanal, Rijeka, Kaštela, Malostonska Bucht, Bucht von Kotor und Velika Vrata. Im Sommer sprudelt aus diesen Quellen relativ kaltes Wasser, das sich schnell mit dem Meerwasser mischt. Unter bestimmten meteorologischen Bedingungen kann an diesen Orten Nebel entstehen. Im Sommer kühlt ein kalter Bora-Wind für kurze Zeit die oberste Schicht des Meeres schnell ab, so dass das Meer solange der Bora weht eine etwas niedrigere Temperatur um 2 bis 4 Grad Celsius beibehält. Die Wassertemperatur in Kroatien wird täglich an über hundert Standorten entlang der kroatischen Küste gemessen. Die Wassertemperatur in Dalmatien, die Wassertemperatur in Istrien und die Wassertemperatur am Kvarner haben ihre eigenen Besonderheiten und tragen zusammen dazu bei, ein komplexes Bild der Meerestemperatur in der Republik Kroatien zu vermitteln.
